西暦2133年の春、未曾有の「寒波」が世界を席巻し、終わりのない「極雪」とそれが生む「雪晄」が降臨した。「雪晄」を浴びた人類は少しずつ記憶と意識を失い、深い眠りに陥り、昏睡のまま命を落とすことになる。 人類社会を維持するために、連合政府は避難所を建て、それらの避難所を維持するために自動地上物資輸送ネットワークを作り上げた。

西暦2150年、連合政府がスーパーコンピュータで、「極雪がもたらす嵐はまた新たな爆発時期を迎える」と予言した。大規模なパニックが再び人類社会を混乱に陥れ、いくつかの避難所が内部衝突で壊滅した。 一方、今の科学技術ではこの災難を防げることができないと連合政府が確認し、代わりに「プロジェクト：忍冬」を始動した。 「プロジェクト：忍冬」の基本として、太平洋赤道あたりの人工島にて、人類は「イザリア」の建造と実験を始めた……

2174年11月、連合政府はイザリアが正式に開始されたと宣言した。 資格を持つ人類はノードシティの地下の集中休眠エリアに入り、休眠と霊子化を行った。 その精神、意識、記憶は霊子データと化し、「霊子データベース」に保存され、イザリアに入った。 一方、連合政府は防衛警備隊を作り、オムニックと警備隊でノードシティと霊子中枢を保護していた。 この時代に人類は二つの世界へと分岐した…… 一部の人は現実を選んだ もう一部の人はイザリアにした。

今のイザリアにおいて、その最も輝くセンターシティ、即ちエルトリスである。繁栄しているイザリアを前にして、人類たちはすぐここに慣れ、そして耽けた……ここで、人類たちは己の生活、夢、希望を取り戻した……娯楽、仕事、社交、恋愛、ここでは皆実現した……新たな始まりは全てここで展開し、新たな生活という甘い夢が、人類に氷結された現実と滅亡の痛切さを忘れさせた…… しかし、こうした繁栄と平和はそんなに長く続かなかった……外からの侵食危機、人類内部の分岐、人類と異格者との矛盾も、密かにはらんでいた……